Протоколы MGCP и Megaco очень похожи друг на друга, и для многих приложений не имеет значения, какой из них будет использоваться. Однако Megaco лучше интегрирован с приложениями с поддержкой нескольких сред передачи, чем MGCP, потому что в базовый протокол включены семантические элементы для конференций. Благодаря этому MGCP может быть лучшей основой для приложений, не привязанных к какой-либо среде, например для управления сеансами на базе MPLS.
Следует отметить, что вопрос о принятии Megaco в качестве международного стандарта для приложений с различными средами передачи данных является пока открытым, хотя некоторые производители приступили к внедрению данного протокола в свои продукты. Подтверждением этого является то, что в конце августа 2000 г. в лаборатории функциональной совместимости университета Нью-Гемпшира проводилось тестирование уже более десяти независимых разработок, использующих протокол Megaco [70].